它是一種兩性離子緩沖液，它與許多常見金屬形成強絡合物；因此，穩定常數選擇此緩沖液時應考慮濃度。它可用于蛋白質結晶的解決方案和作為移動陽離子交換色譜中的相緩沖液和洗脫液。
用于含金屬離子的溶液中，因為它不會與大多數金屬形成絡合物。MES通常用于酵母，細菌和哺乳動物細胞的緩沖培養基中，但濃度高于10 mM時對植物有毒。MES在各種色譜和電泳實驗中也是很好的緩沖液選擇，因為它顯示出較低的離子遷移率和電導率。在pH值為5.5至6.7的范圍內，它是一種有效的緩沖劑。
常用于細菌、酵母和哺乳動物細胞的培養基。它通常用于細胞培養基，作為電泳中的運行緩沖液和蛋白質純化。MOPS被認為是用于在瓊脂糖中分離RNA的極佳緩沖液凝膠，由于發生的高分辨率分離和缺乏相互作用MOPS和RNase抑制劑DEPC之間的差異。它也被視為用途SDS-PAGE中的運行緩沖液。
它缺乏與大多數金屬離子形成絡合物的能力，一般用作金屬離子溶液中的非配位緩沖液。它用作毛細管電泳中的載體電解質，以及谷胱甘肽合成酶的結晶緩沖劑；在熒光光譜法，分光光度法和等溫滴定量熱法中使用；與牛血清白蛋白（BSA）的肽骨架相互作用，防止BSA熱變性；用作緩沖炭酵母提取物培養基的組成成分；用作測定生物治理海洋原油副產物的緩沖體系。
它實際上不溶于水，但如果游離酸增加PIPES的溶解度用NaOH將其轉化為鈉鹽。缺乏與大多數金屬離子形成重要絡合物的能力，一般用作金屬離子溶液中的非配位緩沖液。該緩沖區能夠形成自由基，因此不適用于氧化還原反應。雖然PIPES可用作陽離子交換色譜中的緩沖液，但它應該由于相對較大的離子強度和濃度對pKa的依賴性。PIPES被認為是一種極好的固定緩沖液用于電子顯微鏡的植物細胞。
它能較長時間控制恒定的pH范圍，低濃度的HEPES對細胞無毒性作用，常用于細胞培養，比如各種細菌、真菌的培養液或病毒保存液中可以通過添加HEPES來維持細胞、細菌、病毒所需的pH環境。另外，它能干擾DNA和限制性內切酶之間的反應，但程度低于類似的具有較少取代胺基的緩沖液，這種缺乏干擾的發生主要是因為質子化叔胺的空間位阻在HEPES中允許與DNA的負電荷比大多數更弱。
HEPPSO
HEPPSO已被用作糖原合成酶的結晶緩沖液酶和與HEPPSO復合的酶。HEPPSO對指示物種Daphniamagna幾乎沒有毒性，因此被認為適合毒理學研究。該緩沖區能夠形成自由基，因此不適用于氧化還原反應。HEPPSO形成一個與Cu2+離子絡合；因此，穩定性常數和濃度應為在含有銅離子的溶液中使用該緩沖液時要考慮到這一點。雖然HEPPSO與銅離子結合，但它仍然是適用于二辛可寧酸。
作為DNA篩分體系中常用的緩沖液體系，也可作為RNA樣品的緩沖液成分；適用于葉綠體薄層備樣的電子傳遞和磷酸化研究；可作為毛細管區帶電泳進行蛋白微量分析的背景電解質；能維持反應體系的pH值。常用于一些生化診斷試劑盒、PCR診斷試劑盒以及DNA/RNA提取等試劑盒當中。
