如何選擇緩沖區
選擇緩沖區時，重要的是要考慮每個緩沖區的優缺點。首先，您計劃在實驗中使用的試劑的pH范圍必須與您選擇的緩沖液的pH范圍一致。其次，您必須考慮濃度，緩沖液毒性，溫度和反應性。緩沖液的濃度必須足以說明您計劃在實驗中使用的酸或堿的量。您計劃使用的pH改變成分越多，所需的緩沖液濃度就越高。緩沖液毒性非常重要，因為某些緩沖液可能會對正在使用的細胞產生毒性，因此，如果不確定毒性，可以在實驗中使用緩沖液之前先對細胞進行測試。您還應確保決定使用的緩沖液不會在實驗中產生不需要的反應。
Tris和Tris HCl溶液
可用于包括TAE和TBE在內的各種緩沖溶液中。例如用于SDS-PAGE。其有效pH范圍是7.0至9.0。Tris緩沖液的兩種常見形式是Tris堿和Tris HCl。調節Tris堿的pH值可能是一個挑戰，但是使用Tris HCl而不是通過添加NaOH或HCl來調節pH可以簡化此過程。使用Tris HCl替代NaOH或HCl的其他優點包括安全性和可重復性。
注意事項：
使用Tris溶液的一個技巧是溶液的pH值非常依賴于溫度。因此，應在使用緩沖液的溫度下制備Tris。此外，應避免使用含Tris緩沖液的含銀單結pH電極。
HEPES是兩性離子Good's緩沖液，在6.8至8.2的pH范圍內有效。這使HEPES在生理pH值下成為有效的緩沖液。該緩沖液可用于多種生物的細胞培養基中。它也可用作蛋白質研究中的結合緩沖液，用于陽離子交換洗脫實驗中，以及在凝膠電泳中用作運行緩沖液。
注意事項：
HEPES可溶于水，并且通常具有生物惰性。然而，它確實參與了產生自由基的氧化還原反應，并干擾了DNA與限制酶之間的反應，但是由于空間位阻，其干擾程度小于Tris。同樣重要的是要注意，當使用異質連接蛋白通道時，不應使用HEPES，因為它會抑制其功能。如果要進行毒性研究，請選擇HEPES鈉鹽而不是游離酸。
PIPES是哌嗪緩沖液家族的一員，與HEPES屬于同一家族。它是兩性離子Good's緩沖液，在6.1至7.5的pH范圍內有效。由于pH范圍與HEPES略有不同，PIPES的濃度僅為HEPES濃度的一半。該緩沖劑不會與金屬絡合，因此可用于含金屬離子的溶液。它也可以用于色譜分析，電子顯微鏡固定植物細胞，以及代替草甘膦緩沖液。
注意事項：
直到溶液的pH值升高到6.5以上時，PIPES的游離酸才容易溶解，但是PIPES的鈉鹽很容易溶解。如果使用的是游離酸形式的緩沖液，請使用氫氧化鈉將其轉化為鈉鹽，以提高在較低pH下的溶解度。像HEPES一樣，PIPES不適用于涉及氧化還原反應的實驗，因為它會導致自由基的形成。
